不能把“功劳”都算到m6A头上,FTO不仅仅是m6A去甲基化酶
1、不能把“功劳”都算到m6A头上,FTO的功能确实不仅限于作为m6A去甲基化酶。具体来说:FTO在m6A修饰中的角色:FTO最初被发现能够催化RNA上的m6A去甲基化,这是其在m6A修饰中的重要作用。然而,随着研究的深入,人们发现FTO的功能远比这更复杂。
2、然而,2017年,Samie Jaffrey教授的研究提出,FTO的作用底物可能是m6Am,而非m6A。m6A与m6Am在结构上非常相似,但功能和相应的甲基化酶至今未明。Jaffrey教授的研究发现,FTO通过调节mRNA的m6Am水平,影响RNA的稳定性和翻译效率。最近的研究进一步揭示了FTO的作用底物多样性。
3、去甲基化酶,如FTO和ALKBH5,负责去除已经甲基化的m6A。FTO,与肥胖相关,是已知的去甲基化酶之一,其异常与多种疾病有关。ALKBH5则在细胞核内对mRNA进行去甲基化,其独特的结构使其具有选择性。
m6A甲基化动态可逆和m6A甲基化的识别怎么理解?
m6A甲基化是动态可逆的,其状态可以随细胞状态和环境条件的改变而改变,体现了RNA分子的动态调控特性。识别m6A甲基化,主要依赖于meRIP-seq技术,通过特异性抗体富集和测序,能够准确鉴定m6A修饰位置。易基因科技自主研发的微量RNA甲基化检测技术,具有极低的样本起始量需求,仅需5μg总RNA即可实现有效检测。
其次,m6A甲基化并非静态存在,而是具有动态可逆性。这意味着m6A甲基化状态可以在RNA分子上进行添加和去除,这一过程受到多种因素的影响,如RNA结合蛋白的作用,为m6A甲基化的调控提供了可能。
总结:m6A甲基化是一个复杂而精细的调控过程,涉及多个关键分子的协同作用。通过动态可逆的m6A修饰,细胞能够精确地调控基因表达、RNA代谢和细胞功能,从而维持机体的正常生理活动。这一过程的异常与多种疾病的发生发展密切相关,为疾病治疗提供了新的潜在靶点。
m6A甲基化的基本概念是:在RNA分子,特别是信使RNA中,腺苷的第六位碳上的氮原子N6位置添加甲基的化学修饰。这是转录后过程的一种表现,发生在RNA合成后,并且是一个动态的可逆过程。m6A甲基化的作用过程包括以下几个关键步骤:编写器添加m6A修饰:核心成员:包括METTLMETTL1WTAP等蛋白质。
m6A甲基化是一个动态的可逆过程,包括“编写器”(m6A甲基转移酶)添加m6A修饰,“擦除器”(去甲基化酶)移除m6A修饰,以及“读取器”(m6A结合蛋白)识别这些修饰并介导其生物学功能。
m6a甲基化怎么研究
1、m6A甲基化的研究可从基础理论、研究方法和研究方向三方面展开。基础理论m6A甲基化修饰具有可逆性、动态性和时序性,可在不改变基因序列的前提下,对基因表达进行快速、精准的调控。
2、MeRIP-qPCR技术是在MeRIP-seq技术的基础上,通过定量PCR技术对特定基因或区域的RNA甲基化水平进行定量检测。技术流程:RNA片段化/富集:根据研究对象(如mRNA或lncRNA)的不同,对RNA进行特异性富集和打断。抗体孵育:使用m6A特异性抗体与RNA进行孵育,抓取有甲基化修饰的RNA片段。
3、数据分析:将测序数据比对到参考基因组/转录组上,检测RNA甲基化位点,并进行后续的生物信息学分析。MeRIP-qPCR技术 MeRIP-qPCR技术是一种基于MeRIP-seq技术的定量检测方法,用于验证MeRIP-seq结果或检测特定基因的m6A甲基化水平。
4、富集方式:根据研究对象的不同,选择使用oligodT磁珠富集或去除rRNA后再打断。 结果计算:需要考虑IP到的RNA量与不IP直接保留的Input RNA量之间的差异,计算稀释倍数DF和IF,以准确评估m6A甲基化水平。
METTL3在m6A甲基化修饰中的作用机理是什么啊?
1、m6A甲基化发生在转录后,并富集于3非编码区域、5非编码区域和终止密码子附近的共识基序-RRACH基序(R表示A或G;H表示A、C或U),m6A修饰是可逆的,它的动态化调节过程包括三部分,分别是“writer”甲基化酶,”eraser”去甲基化酶以及“reader”甲基识别蛋白,它们分别执行着不同的功能。
2、m6A修饰,即N6-甲基腺苷修饰,是真核mRNA中含量最丰富的修饰之一。在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中,m6A修饰的研究揭示了其通过特定机制影响肿瘤进展的新发现。m6A修饰的基本概述 m6A修饰是由甲基转移酶样蛋白3(METTL3)、甲基转移酶样蛋白14(METTL14)和Wilms肿瘤相关蛋白(WTAP)共同添加的动态RNA化修饰。
3、其中,METTL3作为一种RNA甲基转移酶,催化甲基转移到RNA的N6 -腺苷,是这一过程的关键介质之一。METTL3在多种疾病的发生发展中扮演重要角色,比如癌症、心血管和神经系统疾病等。因此,研究METTL3的作用机制和抑制剂的发现,对理解这种酶的生物学作用并开发新治疗方法具有重要意义。
4、而在参与m6A甲基化修饰的酶中,METTL3为催化核心。早在2017年,剑桥大学Tony Kouzarides教授领导的一个团队就在Nature杂志上发表研究指出,METTL3酶在AML的发展和维持中发挥关键作用,并将该酶鉴定为AML的潜在治疗靶标。此次研究则进一步验证了这一靶点的有效性,并开发出了针对该靶点的药物STM2457。
5、综上所述,METTL3通过与eIF3h相互作用,使mRNA环化形成loop,提高核糖体循环利用效率,增强翻译效率。这一在终止密码子和5’端的成环机制可能提供更高效循环利用核糖体的方式,且与RNA的m6A修饰关系不大。这一发现为癌症治疗提供了新的视角。
6、Writer实验技术:针对甲基转移酶复合物(如METTL3)进行功能验证,检测其活性并分析其对基因表达的调控作用。研究方向基因表达调控:研究m6A在mRNA剪接、稳定性、运输和翻译中的作用,揭示其对基因表达的精细调控机制。
m6A可调节表观遗传修饰来治疗癌症?这篇文章总结得很完善
1、m6A确实可以通过调节表观遗传修饰来治疗癌症,以下是对此观点的详细总结:m6A甲基化是一种重要的RNA修饰:m6A甲基化是RNA修饰中最为丰富的一种,尤其在哺乳动物mRNA中。m6A在mRNA稳定性中起关键作用,对许多发育过程至关重要。
2、m6A调节蛋白的三个功能组件:m6A写入器、擦除器和阅读器,共同调节mRNA或非编码RNA的m6A修饰。这些蛋白质之间的复杂相互作用调节m6A效应,影响mRNA表达。研究显示m6A与癌症相关,包括凋亡、细胞侵袭性、癌症干细胞自我更新和对化疗的耐药性。
3、近年来,表观遗传修饰领域异常火热,m6A作为mRNA和lncRNA中最丰富的修饰类型,主要存在于3’UTR区域。RNA的m6A修饰由编码器、消码器、读码器三类蛋白共同调控,参与剪接、转运、稳定性、翻译效率、二级结构等多个过程,对细胞功能至关重要。
4、lncRNAs的特性,如长度、编码能力、表达特异性等,使其在肿瘤调控中具有独特的价值。它们通过与染色质结构的互动,如XIST的沉默机制,展示了m6A修饰在细胞核内的调控作用。而在肿瘤中,m6A修饰的缺失可能影响肿瘤发展,尽管mRNA层面的研究较多,lncRNA的m6A修饰作用仍需更多探索。
5、越来越多的科学证据显示,mRNA化学修饰,尤其是甲基化修饰可调控基因表达,参与细胞分化、生物个体发育及癌症疾病等重要生命过程,该领域被称为RNA表观遗传学或表观转录组学。
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